Forse non tutti sanno che la prima serie, trasmessa su Italia Uno, è stata interrotta in attesa del completo doppiaggio di altre puntate. Difatti, nell'autunno 2007, sulla medesima rete televisiva arriveranno gli ultimi 54 episodi che completeranno la serie. Nel frattempo, dal 15 Febbraio 2007, sulla televisione giapponese, ogni giovedì alle 19:30, i giapponesi hanno la possibilità di guardare le puntate della seconda serie di Naruto, detta Naruto Shippuden (cronache dell'uragano).

La serie è ambientata al Villaggio della Foglia, due anni e mezzo dopo la prima. Sasuke, come già nella prima serie, aveva abbandonato i compagni per seguire Orochimaru: egli, infatti, gli aveva promesso di fargli apprendere un'enormità di tecniche anche se, all'insaputa del giovane Uchiha, mirava al possidimento del corpo del giovane. Naruto, dopo due anni di addestramento con Jiraya, ha imparato finalmente a combinare il Rasengan con il suo elemento, il vento, creando così una potente tecnica. Nel frattempo, al Villaggio della Foglia sono cambiate molte cose: il gruppo di Konohamaru, ad esempio, è diventato un agguerito gruppetto di giovani Genin. Sakura è divenuta un ninja medico, Neji è Jonin e Shikamaru Chunin. Ma la cosa più sorprendente è l'improvviso cambiamento di Gaara grazie a Naruto: egli, infatti, è il Kazekage del Villaggio della Sabbia.